显性效应dominance effect等位基因间互相作用产生的效应，亦即基因型值(G)与其加性效应值(D)的差。又叫显性离差，以H表示，即H=G-D(设上位性效应I=0)。其值可为正数或负数，大小取决于群体中的基因频率，并是各位点内显性值的总和。
从遗传平衡群体的某一位点的一对等位基因出发，分别给基因型AA、Aa、aa指定基因型值d、h和-d，从基因型值减去育种值就可以求出显性值。但由于育种值是用距群体平均数(M)的离差表示的，所以基因型值也得先变换成离均差。估算AA的显性效应的步骤是：❶基因型值减群体平均值，即d-M=d-〔d(p-q)+2pqh〕 =2qd-ph+2pqh〕 =2q(d-ph);
❷再从其中减去A基因的育种值2q 〔d+h(q-p)〕（见加性效应）得2q(d-ph)-2q〔d+h(q-p)〕=-2q2h。同样，可算出Aa的显性效应为2pqh,aa为-p2h。为了明确相互间的对比关系，把上述基因型值的各成分列成下表：
基因型值、育种值和显性效应值对比
| 基 因型 | AA | Aa | aa | | 频 率 | p2 | 2pq | q2 | | 指 定 值 | d | h | -d | | 基因型值 | 2q(d-ph)
2q(α*-qh) | d(q-p)+h(1-2pq)
(q-p)α+2pqh | -2p(d+qh)
-2p(α+ph) | | 育 种 值 | 2qα | (q-p)α | -2pα | | 显性效应 | -2q2h | 2pqh | -2p2h |
*a为基因代换平均效应，其值为d+h(q-p)
许多重要的经济性状是由多个位点控制的，其效应为单个位点的累计值H，等于∑(h+)-∑(h-)。
从基因型的显性效应概念及其数值中可以看出，所有基因的显性离差，都成为h的函数。当显性不存在时，则h为零，育种值跟基因型值相等。没有显性作用的基因，有时称之为加性基因，即起累加作用的基因。显性效应是解释特殊配合力和杂种优势的遗传基础，是遗传方差中显性方差的来源，在杂种优势利用中，如果显性效应重要，特别是有超显性存在时，先使亲本自交纯化，接着选测配合力，然后再杂交是有利的。显性效应dominant effect又称杂合效应。基因相互作用的效果之一。在等位基因内，不同成员之间的相互关系。可分为：
❶完全显性。一对等位基因不同时，只有其中一个能显示其表型效应，另一个完全不表现。
❷不完全显性。杂合体表现出两者之间的中间状态。
❸共显性。一对等位基因，相互不存在显隐性关系，杂合体两个成员的作用都能表现。
❹超显性。由于来自一对杂合等位基因的直接产物，相互间发生作用，产生超过其中任何一个纯合状态时的表型效应。 |